Para renombrar un fichero que está dentro de un repositorio git y seguir haciéndole seguimiento, se pueden utilizar los comandos individuales:

Recientemente le comentaba a un compañero que en R los índices de los arrays (sus equivalentes, vectores, listas, etc) empezaban en uno. Su respuesta fue elocuente:

Hadley Wickham nos cuenta en su The tidy tools manifesto1, algunas de sus claves a la hora de escribir funciones (la traducción es mía):